software

モチベーション

自分でオンプレミスでサーバを構築して、そこでJupyterlabサーバを設定してメインに使っている（こちらやこちら）。そうは言っても、GCPから提供されているGoogle Colaboratoryを使ったこともある。

この記事では、最近発表されたAmazon SageMaker Studio Labを試してみたので、使えるようになるまでの手順や使った感想をまとめたい。

モチベーション

分散処理の実験をやってみたかったので、かねてからインストールしようと思っていたOpenMPIをインストールする。 ホスト上のアプリケーションから使えるだけでなく、Singularityで動作するアプリケーションでOpenMPIを使えるようにする。

モチベーション

High Performance Computing用にコンパイラやGPU対応のライブラリ、ミドルウェアをパッケージとしてまとめている「NVIDIA HPC SDK」がある。このNVIDIA HPC SDKをSingularityコンテナとして利用したかったので、Singularityコンテナ作成手順をまとめた。

モチベーション

この記事で数式を使った記事を書いた。この時2つの問題が起こった。

• インライン形式で記述した数式が表示されない。ディスプレイ形式では表示されている。
• ディスプレイ形式の場合に、alignで複数行にならない。

ここでは、上記の解決策をアップする。

モチベーション

以前の この記事で、dockerコンテナからsingularityコンテナを作成し、jupyterlabをsingularityコンテナで動かす記事を書いた。

今回、singularityへの理解を深めるため、definitionファイルからsingularityコンテナを作成した。この記事は、その際の情報をまとめたもの。

はじめに

以前この記事でWorkstationにUbuntu 20.04をクリーンインストールしたことを書いた。そのWorkstationにDocker, Singularityをインストールしたので、自身のメモのため、以下に記事としてまとめる。

はじめに

2年前の2019年2月にヤフオクで、購入したHP Z620 Workstation。購入後、 Ubuntu 18.04をインストールして、Docker, Singularity,コミュニティ版のPGIコンパイラーをインストールして、遊んで来た。

今回、リリース後1年経つUbuntu 20.04をクリーン・インストール（まっさらな状態からのインストール）することにした。 自分自身の備忘のため、ここに記事としてまとめる。

モチベーション

久しぶりに、記事を書こうとして、マークアップエディタ（Typora）を起動するも、記事書けない。というのも、冒頭にタイトル、日付、タグ付けの入れ方を忘れたのだ。

3ヶ月も経つと、以前にやったことを忘れてしまう。そのためのこのブログなので、細かいことも書いておこうと思い、今回は、ブログ記事の冒頭、いわゆる「YAML front matter」について簡単にまとめる。

モチベーション

GitHub PagesとHugoで記事を書き始めたのが、数日前。

何通かポスト（記事を書いて）して、次の3つのことがやりたくなって、ちょっと試してできるようになったので、記事としてまとめる。

• 記事の画像ファイルを埋め込む
• 記事をカテゴリ（category）で分類する
• ブログトップでの記事要約（summary）を短くする

はじめに

我々のまわりを構成している物質（原子）のほとんどは、夜空に輝く星（恒星）の進化過程でその内部で核融合反応により作られたものだ。天文学に興味を持った頃、そのような事実を知って、とっても興味を持った。自分の体を構成する炭素、今飲んでいる水を構成する酸素など、全て恒星が作ったものだと。その興味そのまま、今に至っている。

星の進化をシミュレーションするソフトウェアが、今回のテーマであるMESA(Modules for Experiments in Stellar Astrophysics)だ。