Openmpi

はじめに

OpenMPI実行ノードの順番を決めるhostfileを変更して、姫野ベンチマークでOpenMPIの性能を再測定したことを、この記事として投稿した。投稿後、改めて考えてみて、CPU、クロックの性能から自分が判断するのではなく、客観的な数値で判断することにした。

そこで今回、個々のワークステーション（ノード）の性能を測定し、その結果に従ってhostfileの順序を決め、再々測定することにした。

はじめに

1ヶ月前のこの投稿で、姫野ベンチマークによるOpenMPIの性能を測定した。その記事を見た先輩からhostfileの順番について改善点を指摘していただいた。この投稿では、hostfileを修正して再度性能測定した結果をまとめた。

モチベーション

昨日のこの投稿の通り、複数ノード上で動作しているDockerコンテナでOpenMPIを使ったプログラムを動かせるようになった。OpenMPIによってどのぐらい性能が向上するのかを調べたくなったので、ベンチマークすることにした。 実は、今回も少し苦労した点があり、その部分が他の方の参考になれば嬉しい。

モチベーション

以前このポストで述べたように、Athena++をマルチノードで動かすことをゴールに進めている。その前段階として、OpenMPIを設定したDockerコンテナを複数ノードで実行させることを試みた。自分としては、少し苦労した点もあり、他の方にも参考になるかもしれないので、今回実施したことをまとめ投稿する。

モチベーション

分散処理の実験をやってみたかったので、かねてからインストールしようと思っていたOpenMPIをインストールする。 ホスト上のアプリケーションから使えるだけでなく、Singularityで動作するアプリケーションでOpenMPIを使えるようにする。